人工智能在人类基因组中发现了一个未知的幽灵祖先

没有人知道她是谁，只知道她与众不同：一个 5 万多年前的少女，拥有如此奇怪的排他性，似乎是科学家从未见过的现代人类的“混合”祖先。

直到最近，研究人员才发现证据表明她并不孤单。 在 2019 年的一项分析人类史前史复杂混乱的研究中，科学家们使用了 人工智能 (AI) 以识别现代人类在数千年前走出非洲的长途旅行中遇到并爱抚的未知人类祖先物种。

“大约8万年前，发生了所谓的非洲出埃及记，当时一部分已经是现代人的人口离开非洲大陆，迁移到其他大陆，形成了现在的所有人口，” 解释 西班牙庞培法布拉大学进化生物学家Jaume Bertranpetit。

当现代人类在欧亚大陆的陆地上开辟这条道路时，他们也塑造了其他一些东西——与其他物种的古代和灭绝人类杂交。

直到最近，人们还认为这些随意的性伴侣包括尼安德特人和丹尼索瓦人，后者直到 2010 年才为人所知。

但在这项研究中，由于深度学习算法扫描了古代和现代人类遗传密码的复杂块，很久以前在欧亚 DNA 中分离出了第三种前体。

使用统计技术称为 贝叶斯推理研究人员发现了他们所谓的“第三次内向”的证据——一个古老的“幽灵”群体，现代人类在非洲迁徙期间与之杂交。

“这个群体要么与尼安德特人和丹尼索瓦人的血统有关，要么与丹尼索瓦人的血统早期分道扬镳，” 在他们的论文中写道，这意味着人类性史中的第三个群体很可能是他们自己的混合体 尼安德特人 和 丹尼索瓦人.

从某种意义上说，从深度学习的角度来看，它是2018年确定的少女的一种“杂交化石”的假设证明； 虽然还有更多的工作要做，但研究项目本身并没有直接关系。

“我们的理论与最近在丹尼索瓦发现的混合样本相匹配，尽管我们还不能排除其他可能性，” 团队成员之一，基因组学家 Miuch Mondal 来自爱沙尼亚塔尔图大学的研究人员在发现时在一份新闻稿中说。

然而，这一科学领域的发现正在不断涌现。

同样在 2018 年，另一组研究人员与丹尼索瓦人和尼安德特人一起确定了他们所谓的“定义第三次杂交事件”的证据，并且在 2019 年初发表的两篇研究论文更清晰地追溯了这些灭绝物种如何交叉和繁殖的时间表。比以往任何时候都详细。从什么时候开始。

这里还有很多研究要做。 应用这种类型的人工智能分析无疑是人类起源领域的一项新技术，而我们正在处理的已知化石证据却出奇地稀缺。

但根据研究，该团队的发现不仅解释了被遗忘已久的窥探过程——前戏以自己的方式告知了我们今天的一部分。

“我们认为我们会尝试在基因组中找到这些差异很大的地方，看看哪些是尼安德特人，哪些是丹尼索瓦人，然后看看这是否能解释整个情况，”Bertranpetite 说。 史密森尼.

“碰巧的是，如果你减去尼安德特人和丹尼索瓦人的部分，基因组中仍然有一些非常不同的东西。”

结果已发表在 自然联系.

本文的一个版本最初发表于 2019 年 2 月。